GMP实验室的门窗应设置观察窗，一般不应设置门槛，门扇应设计为向外开或里外双开，在紧急情况时便于人员逃生，有隔音、屏蔽、保温等需求的实验室可选用具备相应功能的门，对洁净和禁止无关人员进入的实验室可选用可自动关闭带锁的门；外窗类型有固定窗、可开关的窗、双层窗、隔音窗、屏蔽窗、密闭窗等，可根据实际情况进行选择；实验室窗户在满足采光要求的情况下，应减少外窗的面积，并具有良好的密闭性和隔热性，窗户应安装防虫纱网和遮阳装置，防止昆虫、鼠类等小动物进入。
实验室的墙面和地板等室内装修结构除了符合严格的防尘、防滑、耐磨、防水、光洁、易于清洁、不眩光等要求外，还应该符合实验室安全要求；墙面结构应防止强的反光效果，具备一定的耐酸碱耐腐蚀作用，具有较好的隔热和隔音效果，并要求方便清洁，有电磁波干扰的房间，墙面需做相应的屏蔽处理；实验室四面采用各种防滑地砖或合成树脂类塑胶地面，要求坚实耐磨、防水、防滑、防静电、防尘、耐酸碱腐蚀，并具有一定的防振效果。实验室走道是人员和物品的通道，在平面设计布局时，应考虑设有便于疏散撤离的顺畅无阻的安全通道，双面布房的通道宽度不宜低于1.8m，单面布房的通道宽度不宜低于1.5m。
实验室建筑的布局形式有多种平面类型，根据建筑物平面结构的不同可设计成多种不同的组合形式，并在不同区间进行相关功能室的局部组合，形成完整的实验室布局；布局形式有：单走廊设计、双走廊设计、组合式设计；空间的布局形式上，应尽量减少实体的横隔墙，在同一个实验室区域内，尽可能采用框架式的隔墙比较有利于实验室各个功能间的视线、沟通和设施设备的使用；分割形式有多种，各种实验架、实验台、实验柜、通风柜都可以用来分隔实验室的空间；对光线、温湿度或有交叉污染需要严格进行隔离的区域，则须进行有效的隔离并监控隔离效果。
