基因扩增实验室选址、设计和建造应符合国家和地方环境保护和建设主管部门等的规定和要求；实验室的建筑材料和设备等应符合国家相关部门对该类产品生产、销售和使用的规定和要求；走廊和通道应不妨碍人员和物品通过。房间的门根据需要安装门锁，门锁应便于内部快速打开；应设计紧急撤离路线，紧急处应有明显的标识，需要时房间的入口处应有警示和进入限制；应有专门设计以确保存储、转运、收集、处理和处置危险物料的安全；实验室内温度、湿度、照度、噪声和洁净度等室内环境参数应符合工作要求和卫生等相关要求；设计还应考虑节能、环保及舒适性要求；实验室应有防止节肢动物和啮齿动物进入的措施。
基因扩增实验室的门应有可视窗并可锁闭，门锁及门的开启方向应不妨碍室内人员逃生；主入口的门、放置生物安全柜实验间的门应可自动关闭，应有进入控制措施；靠近实验室的出口处宜设置洗手池；墙壁、天花板和地面应易清洁、不渗水、耐化学品和消毒灭菌剂的腐蚀，地面应平整、防滑，不应铺设地毯；在实验室门口处应设存衣或挂衣装置，可将个人服装与实验室工作服分开放置，每个实验室的缓冲间内设置存衣或挂衣装置，每个实验室的衣服应有区分标志；实验室台柜和座椅等应稳固，边角应圆滑，台柜等和其摆放应便于清洁，实验台面应防水、耐腐蚀、耐热和坚固；应根据工作性质和流程合理摆放实验室设备、台柜、物品等，避免相互干扰、交叉污染；室内应避免不必要的反光和强光；应按产品的设计要求安装和使用生物安全柜，如果生物安全柜的排风在室内循环，室内应具备通风换气的条件，如果使用需要管道排风的生物安全柜，应通过独立于建筑物其他公共通风系统的管道排出。海洁兴净化可提供基因扩增实验室、PCR实验室的咨询、规划、设计、施工、安装、改造等配套服务。
应有足够的电力供应，应有足够的固定电源插座，避免多台设备使用共同的电源插座，应有可靠的接地系统，应在关键节点安装漏电保护装置或监测报警装置，必要时重要设备如：培养箱、生物安全柜、冰箱等应配置备用电源；应配备适用的通讯设备；供水和排水管道系统应不渗漏，下水应有防回流设计；应配备适用的应急器材，如消防器材、意外事故处理器材、急救器材等；必要时，应配备适当的消毒灭菌设备，应在实验室或其所在的建筑内配备高压蒸汽灭菌器或其他适当的消毒灭菌设备，所配备的消毒灭菌设备应以风险评估为依据。
临床基因扩增实验室入口处可设缓冲间，保持人净路线的合理性，每个实验室有独立的缓冲间，如果条件不具备，各实验室的独立缓冲间也不能少；特殊要求临床基因扩增实验室建议一定具有淋浴区，这样有利于减少污染源与外界环境的接触，如果临床基因扩增实验室不具备淋浴条件，则一定要做好衣物及各种用品的隔离防护措施；洁净室内设备和物料出人口应根据设备和物料的性质、形状等特征设置物料净化用室及其设施，物料净化用室的布置应防止净化后物料在传递过程中被污染；人员、物流、污物流不得走同一通道，跨越不同级别区域的物品可由传递窗传递；临床基因扩增实验室的空气流向可按照试剂储存和准备区→标本制备区→扩增区→扩增产物分析区空气压力逐渐递减方式进行，防止扩增产物顺空气气流进入扩增前的区域，一般来说试剂储存和准备区与标本制备区呈微正压，扩增区和扩增产物分析区呈微负压；样本制备—扩增区—扩增产物分析区压差5Pa左右递减即可。
