仪器、设备、管道等的设计、选型、安装应符合GMP要求，易于拆洗、消毒或灭菌，便于实验操作和维修、保养，并能防止差错和减少污染；设备主体要清洁整齐，无跑、冒、滴、漏，设备与药品直接接触的表面均应光洁、平整、易清洗、耐腐蚀，不与物料发生化学反应或吸附物料。产尘而又暴露的生产设备，应加以封闭或遮盖，并附有吸尘设备，保温层要求全部包扎平整、光洁，不得有颗粒物脱落，并能耐清洗消毒。
实验室内所需仪器设备及零部件需经除尘、清洗、消毒灭菌等必要的净化处理后方可移入，尽量减少搬入搬出，设备运转部件要密封良好，能有效地防止润滑剂、冷却剂污染物料；要正确使用仪器设备，严格按照仪器的标准操作规程进行操作，及时详细地填写仪器设备使用记录；应做好净化空调设备的维修、保养，并达到最大限度节能，空气净化调节系统运行时，要做好运行值班记录，运行中发现问题要及时处理，确保正常使用。实验材料、物料的外包装要求完好，无受潮、混杂发霉，各种标记齐全有检验合格证，方可领用；物料应在准备间进行外包装清洁或处理；进入实验室的材料、工具、仪器、零部件、设备等均应进行擦洗、除尘、消毒等必要的净化处理；实验用的原辅料包装严密，标志明显，内外包装层均要有标明品名、规格、生产厂及批号的凭证，洁净区内的物料放在不影响气流规定位置，并有明显的状态标志。
实验室人员必须随时保持设备和工作区整洁，工作完毕应清理好工作台面，试验操作中，养成严谨的操作习惯，应防止实验材料溅出或雾化，坚决杜绝溶液、试剂滴落污染或腐蚀地面、台面和仪器设备；使用后必须将生物废弃物或药品原料以及其他废弃物，就地包装后由传递窗传出，必须把使用过的各种废物清理干净，将自己的物品带走；空气净化系统及设备应定期检测，室内洁净度也应定期检测。
对清洁工具的基本要求：
不易脱落纤维与微粒，防止污染；
尽量一次性使用，否则应能洗涤干燥；
不同级别的洁净区的清洁工具不能混用；
无菌区的设备与工具，不得选用易滋生微生物的材料，如木质；
使用后的设备、管道与容器，应及时清洗，必要时用无菌水冲洗或消毒。
